Séminaire Philbio : 2017-2018

Le séminaire de Philosophie de la Biologie de l'IHPST a été créé en septembre 2005 par Anouk Barberousse,Michel Morange et Thomas Pradeu. Il a lieu tous les mois, dans la salle de conférence de l'IHPST. Il fait alterner exposés de doctorants et de chercheurs internationaux. Il entend être un lieu de premier plan pour la recherche en philosophie de la biologie.

Responsable (s): 

Séminaire PhilBio - 01- Charbel El-Hani

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Mardi 26 Septembre 2017 - 15:0017:00
IHPST - Salle de conférence

Notre invité sera Charbel El-Hani, Professeur de Philosophie à l'Université Fédérale de Bahia (Institute of Biology, Federal University of Bahia, National Institute of Science and Technology in Interdisciplinary and Transdisciplinary Studies in Ecology and Evolution, INCT IN-TREE), il interviendra sur le thème suivant: 

"Some ideas about genes in the postgenomic era"

Résumé

The gene concept has been one of the hallmarks in 20th century history of science, but is currently shrouded in controversy, given the difficulty for understanding the structural limits of the gene or the meaning of its function. Once conceived according to the so-called classical molecular concept, as a stretch of DNA coding for a functional product, which can be a single polypeptide chain or a functional RNA molecule, the gene amounted to a structural unit clearly delineated in the genome, to which one could ascribe a clear function. Currently, it is not a simple task to delimit what is a gene or explain how it functions. The gene concept is challenged by many problems. Consequently, a number of proposals for reconceptualizing the gene appeared in recent years, in the so-called postgenomic era. In this paper, I will discuss such proposals that emerged in the last 10 years, particularly focusing on Scherrer and Jost’s genon theory. From this discussion, I will derive some ideas regarding the understanding of what is a gene and how a gene functions in the postgenomic era, particularly focusing on the idea of a dynamic, systemic gene. Moreover, I will address results from previous studies on how genes and their functions are discussed in school science knowledge, in order to examine what are the consequences of the treatment of genes along schooling for citizenship education in a society increasingly affected by discourses about genes and genetic technologies. In particular, I will argue that things go seriously wrong in genetics education when not informed by historical and philosophical approaches to the gene.

Séminaire PhilBio - 02 - Tim Lewens

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Lundi 9 Octobre 2017 - 16:0018:00
IHPST - Salle de conférence

Notre invité sera Tim Lewens, Professeur de Philosophie des sciences (University of Cambridge), son intervention portera sur le sujet suivant: 

"Neo-Paleyan Biology"

Résumé: 

This talk explores an ongoing tradition -- and perhaps a surprising one -- that we can helpfully characterise as ‘Neo-Paleyanism’. Prominent evolutionary thinkers from Darwin to Maynard Smith to Dawkins have repeatedly cited the work of the natural theologian William Paley with approval. Of course, they vehemently deny that biological phenomena demand explanation in terms of a designing intelligence. But they recommend attention to Paley’s criteria for the detection of adaptation in nature, and in some cases they have explicitly conceived of evolutionary processes in terms of the creation of design. The talk concludes with discussion of the most recent version of Neo-Palyenism, which we owe to Grafen and Gardner.

Publications:

Why We Disagree About Human Nature (Oxford: Oxford University Press, forthcoming). Edited with Elizabeth Hannon.

The Meaning of Science (London: Penguin, 2015)

Cultural Evolution: Conceptual Challenges (Oxford: Oxford University Press, 2015)

The Biological Foundations of Bioethics (Oxford: Oxford University Press, 2015)

Risk: Philosophical Perspectives, editor (London: Routledge, 2007)

Darwin (London: Routledge, 2007)

Organisms and Artifacts: Design in Nature and Elsewhere, Bradford Books, Life and Mind Series (Cambridge, MA: MIT Press, 2004)

https://www.people.hps.cam.ac.uk/index/teaching-officers/lewens

Séminaire PhilBio - 03 - Helen Longino

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Lundi 6 Novembre 2017 - 16:0018:00
IHPST - Salle de conférence

Notre invitée sera Helen Longino, Professeure de philosophie (Stanford University), elle interviendra sur le sujet suivant:

 “Sex, Race, and Sciences of Human Behavior”

Résumé: 

Behaviors must be classified, behavioral concepts must be operationalized (made measurable) in order they can be susceptible to empirical study.  This talk examines the basis of recent operationalizations of aggression and sexual behavior and explores their (unintended) social consequences.

 

http://press.uchicago.edu/ucp/books/book/chicago/S/bo13025491.html

 

Séminaire PhilBio - 04 - François Képès

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Lundi 27 Novembre 2017 - 16:0018:00
IHPST - Salle de conférence

Notre invité sera François Képès, biologiste cellulaire (Synovance, Académie des Technologies), son intervention portera sur le sujet suivant: 

La Biologie de Synthèse — Comment ? — Pourquoi ?
 
Résumé: 
 
La biologie de synthèse est l’ingénierie rationnelle de la biologie. L’ambition de ce domaine en pleine effervescence est de concevoir rationnellement et de construire de manière standardisée de nouveaux systèmes inspirés par la biologie, ou fondés sur ses composants. En 12 ans, la biologie de synthèse s’est imposée comme le fer de lance des biotechnologies, et ses applications commercialisées dépassent la centaine. Typiquement, une application vise, en partant de ressources renouvelables plutôt que fossiles, à produire par voie biologique un composé à haute valeur ajoutée, par exemple médicament, complément alimentaire, matériau textile, colorant, parfum etc.
Dans le passé, les avancées significatives de la biologie ont régulièrement contribué à acculer la définition du Vivant dans des recoins de plus en plus exigus. La biologie de synthèse est actuellement bien positionnée pour être la prochaine avancée technologique et scientifique à amenuiser encore le réduit du Vivant — sans pour autant dissiper le mystère de la vie.
Après avoir examiné ce qu’est aujourd’hui la pratique de la biologie de synthèse et son actualité, nous mentionnerons quelques applications récentes, puis discuterons à cette lumière des relations qu’elle induit entre historicité, innovation, auto-organisation, dessein rationnel et évolution. 
 
 

Séminaire PhilBio - 05 - Laurent Loison

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Lundi 11 Décembre 2017 - 16:0018:00
IHPST - Salle de conférence

Notre invité sera Laurent Loison, Chargé de Recherches au CNRS, IHPST. Il interviendra sur le sujet suivant: 

« Assimilation génétique et hérédité des caractères acquis. L’héritage oublié de Conrad Waddington »

Résumé

Depuis la fin des années 1990 et l’ouverture du débat sur l’extension de la Théorie synthétique de l’évolution, le terme d’assimilation génétique est revenu sur le devant de la scène. Néanmoins, le contenu de ce concept demeure difficile à déterminer avec précision. En effet, celui-ci est souvent identifié à l’effet Baldwin, ou intégré au sein du schéma très inclusif de l’ « accommodation génétique ». Cette communication a pour objectif de souligner la spécificité du mécanisme d’assimilation génétique tel qu’il fut initialement élaboré par Conrad Waddington au cours des années 1940 et 1950.

Nous montrerons d’abord que l’effet Baldwin et l’assimilation génétique sont deux mécanismes distincts rendant compte de la même phénoménologie lamarckienne. Nous montrerons ensuite que l’interprétation standard du mécanisme d’assimilation génétique (lorsque celui-ci n’est pas confondu avec l’effet Baldwin), assise sur la notion de seuil d’apparition d’une phénocopie, n’était pas la conception privilégiée par Waddington. Chez Waddington, l’assimilation génétique n’a de sens qu’à la lumière du concept de canalisation et selon une perspective qui a été largement ignorée depuis un demi-siècle. Nous montrerons enfin que le concept originel d’assimilation génétique, parce qu’il renouvelle profondément la vieille question de l’hérédité des caractères acquis, constitue un défi autrement plus sérieux pour la Théorie synthétique que celui posé par l’effet Baldwin.

 

Séminaire PhilBio - 06 - Gustavo Caponi

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Lundi 15 Janvier 2018 - 16:0018:00
IHPST - Salle de conférence

Notre invité sera Gustavo Caponi (Universidade Federale de Santa Catarina). Son intervention portera sur le sujet suivant: 

«La naturalisation darwinienne de la téléologie : les concepts de fonction, adaptation et design biologique»

Résumé

In Natural Selection Theory, the concept of biological function must be supposed to define the concept of fitness; and this one must be supposed to define the concept of adaptation and also to explain the phenomenon to which the last one alludes. These three concepts, on the other hand, are specifications of three concepts of more universal application. The concept of biological function is a particular case of the general concept of function; and the concept of fitness is a specification of the concept of convenience. The concept of adaptation, meanwhile, specifies the concept of design. The visualization of these conceptual joints allows to understanding the legitimacy of the naturalization of the teleology produced by the Darwinism.

 

Séminaire PhilBio - 07 - Alvaro Moreno

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Lundi 29 Janvier 2018 - 16:0018:00
IHPST - Salle de conférence

 

Notre invité sera Alvaro Moreno, Professeur de philosophie des sciences à l'Université du Pays Basque (UPV/EHU).  Son intervention portera sur le sujet suivant: 

“Conceptual issues in the Origin of Life” 

Résumé

Current scientific research sees the origin of life as a set of processes that, together, would explain how, starting from a world dominated by purely physical-chemical principles, it has been possible that a specific set of molecules organize themselves in such a way that they develop a phased process, in which this initial organization has been able to bring forth new and increasingly complex forms of organization, till governing its own variability and deploying an undefined complexity and sustainability. This shared view, however, is full of scientific debates and puzzles, many of them attracting philosopher’s attention. Yet, philosophers should ask too which are the most fundamental issues behind these debates, namely which are the questions that lie behind the different Research Programs in the field, that drive and unify them. In this talk I will present a tentative list of four fundamental questions: the question of the specificity of the relation between matter and form; the emergence of functions; the emergence of individuality and agency; and the significance of unlimited evolvability.

 

Séminaire PhilBio - 08 - Grant Ramsey

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Lundi 12 février 2018 - 16:3018:30
IHPST - Salle de conférence

Notre invité sera Grant Ramsey, Professeur à l'Institut de Philosophie de L'Université de Louvain (KU Leuven), directeur du Ramsey Philosophy of Biology Lab. 

Séminaire PhilBio - 09 - Denis Forest

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Lundi 5 Mars 2018 - 16:3018:30
IHPST - Salle de conférence

Notre invité sera Denis Forest, Professeur à l'Université Paris 1 Panthéon-Sorbonne (IHPST). Son intervention portera sur le sujet suivant: 

"What’s the point of having a nervous system? Models in neurobiology and life’s neural strategy"

Résumé 

Neuroscientists routinely describe neural mechanisms in their endeavor to explain the behavior and the cognitive achievements of animals.  But in his Behavior of the lower organisms, H. S. Jennings already spoke of “the necessity of guarding against overrating the importance of the nervous system” (Jennings, 1906). Animals that do not possess a neural system (like sponges) exhibit some varieties of genuine behavior.  It has recently been argued that unicellular organisms like Physarum polycephalum are able to learn, while learning is a cognitive activity that we usually explain with the working of some kind of neural machinery (Boisseau et al, 2016). We are forced to reconsider life’s neural strategy among non-neural ones.

The talk will consider three kinds of models of what neural systems do: a) input- output models (Parker, 1919; Jekely, 2011), b) internal coordination models (Keijzer, Duijn and Lyon, 2013) and c) forward, that is, predictive models (von Holst and Mittelstaedt, 1950; Hohwy, 2014).  I shall raise questions about the nature and purpose of such models, in reference to Marr’s idea of computational theory (Marr, 1980). I shall ask what the contribution of these models to our understanding of the evolution of nervous systems and brains may be.  Finally, I’ll sketch what the relationships between modelling in neuroscience and philosophy of neuroscience could be, in the spirit of Chang’s idea of complementary science (Chang, 2004). 

Séminaire PhilBio - 10 - Evelyne Heyer

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Lundi 9 Avril 2018 - 16:3018:30
IHPST - Salle de conférence

Notre invitée sera Evelyne Heyer, Professeure d'anthropologie génétique au Muséum National d'Histoire Naturelle (MNHM, UMR 7206). Elle interviendra sur le sujet suivant: 

"L'évolution et la diversité génétique de notre espèce : le rôle de l'interaction entre culture et génétique"

Séminaire PhilBio - 11 - Charles Kollmer

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Lundi 7 Mai 2018 - 16:3018:30
IHPST - Salle de conférence

Notre invité sera Charles Kollmer (doctorant, Princeton University). Son intervention portera sur le sujet suivant: 

"From the Elephant to the Bacterium: Microbes, Metabolism, and the Chemistry of Life"

Résumé

During the interwar period, microbes took on a new role in the laboratory. They became exemplary life forms, used to shed light on the chemistry of metabolism. Where microbiologists working in the late nineteenth century had emphasized the specificity of microbial fermentation and infections, interwar microbiologists cultivated a different expertise; by paying careful attention to what microbes ate and excreted, these investigators extrapolated general theories of how living things obtain the energy that sustains them. From this work emerged compelling evidence for life's biochemical unity, an idea that would have profound effects for the shape of biology to come. In my dissertation, I trace the transformation of microbiology in the interwar period by comparing research conducted by microbiologists in the Netherlands, Germany, Great Britain, France, and the United States. This talk will feature a presentation of one of these case studies and a discussion of its implications for my broader argument.

Séminaire PhilBio - 12 - Catherine Dekeuwer-Carrier

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Lundi 28 Mai 2018 - 16:3018:30
IHPST - Salle de conférence

Notre invitée sera Catherine Dekeuwer-Carrier, Maître de conférences à l'Université Lyon III Jean Moulin.  

Séminaire PhilBio - 13 - Thomas Pradeu

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Lundi 18 Juin 2018 - 16:0018:00
IHPST - Salle de conférence

Notre invité sera Thomas Pradeu, Directeur de Recherches au CNRS (CNRS, Immuno ConcEpT, UMR5164, Université of Bordeaux), il interviendra sur le thème suvant: 

"Pourquoi passer de la Philosophie de la biologie à la Philosophie dans la biologie?" 

 

Résumé

La philosophie de la biologie est un domaine fascinant et qui a connu un développement remarquable au cours des trente dernières années. Pourtant, ce domaine reste de taille réduite, ses problématiques sont relativement peu nombreuses et n’évoluent guère au cours du temps et, surtout, la plupart des biologistes n’ont pas connaissance de la philosophie de la biologie et, lorsqu’ils en ont connaissance, peu s’en servent dans leurs recherches.

Dans cet exposé, je souhaiterais poser les fondements d’une approche particulière, que j’appelle « philosophie dans la biologie », et qui pourrait contribuer à ouvrir davantage la philosophie de la biologie à la biologie en train de se faire. L’objectif majeur de cette approche est de co-produire avec des scientifiques des contributions à la philosophie et à la science. La philosophie dans la biologie a quelques précédents, mais elle reste minoritaire. J’essaierai donc de montrer pourquoi cette ouverture est plus que jamais utile, que les défis à relever pour la réaliser sont immenses mais pas insurmontables, et enfin que cette ouverture ne doit pas se faire au prix d’une moindre exigence philosophique. Il s’agira également de montrer, de manière très pratique, comment faciliter la mise en œuvre de ce travail d’interface entre philosophes et scientifiques.